Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pde6aP27664 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms