Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd1P25322 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms