Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxd8P23463 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms