Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd3eP22646 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms