Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VimP20152 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VimP20152 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms