Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcnaP17918 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms