Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30aP15533 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms