Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UbbP0CG49 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbbP0CG49 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms