Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PtprqP0C5E4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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PtprqP0C5E4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms