Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Me1P06801 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Me1P06801 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Me1P06801 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Me1P06801 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Me1P06801 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms