Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-AaP01910 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-AaP01910 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-AaP01910 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-AaP01910 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-AaP01910 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-AaP01910 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-AaP01910 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H2-AaP01910 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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