Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01878 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01878 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01878 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01878 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01878 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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P01878 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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