Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
P01823 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P01823 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P01823 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P01823 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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