Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CcnkO88874 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CcnkO88874 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CcnkO88874 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CcnkO88874 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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