Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CntfrO88507 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CntfrO88507 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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