Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan6O70401 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan6O70401 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms