Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtssO70370 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtssO70370 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtssO70370 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtssO70370 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms