Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lnx1O70263 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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