Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms