Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg2O55111 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms