Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab33bO35963 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms