Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp2O35711 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms