Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn1mwO35599 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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