Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Atf6bO35451 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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