Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hs3st1O35310 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hs3st1O35310 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms