Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casq1O09165 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms