Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms