Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sec22bO08547 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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