Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna5O08543 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms