Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp35M0QWN7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms