Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm3239L7N2D9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3239L7N2D9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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