Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5225J3QPL3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5225J3QPL3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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