Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm17577J3QNF7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms