Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29394H3BIW7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms