Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r39G3UWE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms