Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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H2-M1F7CXU4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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H2-M1F7CXU4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H2-M1F7CXU4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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