Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8444F6XS56 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms