Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms