Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
ApobE9Q414 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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ApobE9Q414 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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ApobE9Q414 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
ApobE9Q414 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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