Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FgaE9PV24 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms