Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc8D3YZV8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc8D3YZV8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms