Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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