Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Siah3B2RWG3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Siah3B2RWG3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms