Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssxb8B1AY40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ssxb8B1AY40 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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