Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms