Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms