Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930435E12RikA6X8Z9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930435E12RikA6X8Z9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms