Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm6880A3KG45 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm6880A3KG45 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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