Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Atp8b5A3FIN4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Atp8b5A3FIN4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b5A3FIN4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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