Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubb1A2AQ07 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms